GWAS数据分析教程
前言
1
GWAS介绍
1.1
LD
1.2
性状
1.2.1
连续性状
1.2.2
分类性状
2
数据质控
2.1
表型数据
2.2
基因型数据
3
一般线性模型
4
混合线性模型
5
GWAS可视化
5.1
曼哈顿图
5.2
QQ图
6
软件实现
6.1
plink
6.2
TASSEL
6.3
GAPIT
6.4
FamCPU
6.5
rMVP
6.6
GEMMA
公众号：R-breeding
GWAS数据分析教程
Chapter 6
软件实现
6.1
plink
6.2
TASSEL
6.3
GAPIT
6.4
FamCPU
6.5
rMVP
6.6
GEMMA